N-(26-hydroxyhexacosanoyl)sphinganine (YMDB00622)
Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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YMDB ID | YMDB00622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name | N-(26-hydroxyhexacosanoyl)sphinganine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Saccharomyces cerevisiae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strain | Baker's yeast | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | N-(26-Hydroxyhexacosanoyl)sphinganine is a ceramide (a sphingolipid). Ceramides are found in high concentrations within the cell membrane of cells. Ceramides are composed of a sphingosine and a fatty acid. Ceramides are found in high concentrations within the cell membrane of cells. Caramides are known to promote transport of secretory vesicles from the ER to the Golgi apparatus. Sphingolipids like ceramide play import roles in lipid rafts which in yeast are responsible for delivering and sorting membrane bound proteins. Lipid rafts also play roles in membrane fusion during mating.[PMID: 16730802] There are three major pathways of ceramide generation. The sphingomyelinase pathway uses an enzyme to breakdown IPC, MIPC and M(IP)2C in the cell membrane and release ceramide. The de novo pathway creates ceramide from less complex molecules. Ceramide generation can also occur through breakdown of complex sphingolipids that are ultimately broken down into sphingosine, which is then reused by reacylation to form ceramide. This latter pathway is termed the Salvage pathway.[Wikipedia, PMID: 16730802] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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CAS number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Weight | Average: 696.1818 Monoisotopic: 695.679160341 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | XZMFWWLYDZUCKQ-WZYYJWNZSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI | InChI=1S/C44H89NO4/c1-2-3-4-5-6-7-8-20-23-26-29-32-35-38-43(48)42(41-47)45-44(49)39-36-33-30-27-24-21-18-16-14-12-10-9-11-13-15-17-19-22-25-28-31-34-37-40-46/h42-43,46-48H,2-41H2,1H3,(H,45,49)/t42-,43+/m0/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | N-[(2S,3R)-1,3-dihydroxyoctadecan-2-yl]-26-hydroxyhexacosanamide | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name | N-[(2S,3R)-1,3-dihydroxyoctadecan-2-yl]-26-hydroxyhexacosanamide | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Formula | C44H89NO4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as ceramides. These are lipid molecules containing a sphingosine in which the amine group is linked to a fatty acid. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Sphingolipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Ceramides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Ceramides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties |
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Predicted Properties |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations |
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Organoleptic Properties | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMPDB Pathways | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Pathways | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMPDB Reactions | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Reactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Intracellular Concentrations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extracellular Concentrations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra |
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References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: |
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Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
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Enzymes
- General function:
- Involved in heme binding
- Specific function:
- Ceramide hydroxylase involved in the alpha-hydroxylation of sphingolipid-associated very long chain fatty acids. Hydroxylates the very long chain fatty acid of ceramides at C2 and C3
- Gene Name:
- SCS7
- Uniprot ID:
- Q03529
- Molecular weight:
- 44881.10156
Reactions
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Catalyzes the addition of a phosphorylinositol group onto ceramide to form inositol phosphorylceramide, an essential step in sphingolipid biosynthesis
- Gene Name:
- AUR1
- Uniprot ID:
- P36107
- Molecular weight:
- 45192.80078